看会议内容，如果是他是来协助你们工作的，会议还算是你们部门会议的话，你来主持是完全可以的。

部门对部门间的会议就像讨论会一样，谁发起，谁组织，不一定要求职位最高的人来主导。完全可以是一个类似讨论组，圆桌会议等的形式，但这样的会议一定要有明确的主题，待解决的问题，讨论后一定要确立解决的方案，最好还有备用计划，不然这样的会议容易变得松散而没有成效。